We zorgen voor goede verbindingen tussen Stadshavens en de omliggende stadsdelen, zodat de wijk onderdeel wordt van de omgeving. De voetgangersroutes in het gebied sluiten aan op de Oosterparkwijk en het Sontweggebied. Langs zowel het Eemskanaal als het Damsterdiep komen fiets- en wandelroutes voor een goede verbinding met de binnenstad, omliggende wijken, Ten Boer en Meerstad.
Ook komt er een fiets- en voetgangersbrug komt over het Eemskanaal, in het hart van Stadshavens, ongeveer in het midden tussen de Oosterhavenburg en de Berlagebrug.